這些年來，過敏疾病有逐年增加的趨勢，科學家經由這幾年的研究認為，這些年的過敏疾病增加可能與所謂的「清潔理論」有關。大規模的流行病學研究顯示，在過去五十年中一些特定的感染疾病如肝炎、麻疹、腮腺炎和風濕熱等因為病原體感染引起的疾病逐年下降；相對的，如發炎性腸道疾病、多發性硬化症、第一型糖尿病和氣喘等免疫疾病反而是逐年增加。
所以，學者開始認為在過去一世紀來，因為我們在感染疾病的預防和治療，包括疫苗的研發和抗生素的使用，讓感染疾病的發生率急遽降低。因此，研究者認為感染疾病的病原體，對人體的刺激及對人類正常免疫力的發展還是有其重要性，少了病原體的刺激反而會讓人類的免疫系統出現失調。
支持清潔理論的重要研究證據
也就是因為小朋友在出生後較少接觸到一些會促進第一型T輔助細胞的病原體，所以導致過敏疾病的增加。有一些證據支持「清潔理論」：
● 早點上托兒所的小朋友較不易過敏：美國的研究顯示，如果小朋友較早去托兒所或是幼稚園，或是因為家裡兄姐經常由學校帶回一些病原體，雖然容易出現感染的症狀，但是這些小朋友在成長時反而較少發展出過敏疾病。
● 接種卡介苗的孩子較不易過敏：日本的研究也發現，接種卡介苗（BCG）的小朋友，長大後出現過敏疾病的機會也較低，可能與卡介苗能夠誘發出相當好的第一型T輔助細胞活性也有關。
● 使用二手嬰兒床的嬰孩較不易過敏：研究也顯示，小寶寶出生後如果使用舊的嬰兒床，其以後出現過敏疾病的比例也比那些使用新床的小寶寶低。
● 在牧場出生的孩子較不易過敏：研究也發現，在牧場出生和長70大的小朋友，雖然一天到晚都接觸到牧草，但是長大後發展出過敏疾病的機會也較低。
病原體或是環境中的內毒素有助寶寶免疫發展
這些研究都顯示，小寶寶出生後適當地接觸一些病原體或是環境中的內毒素（所謂「內毒素」就是一些已經產生細菌的細胞壁或是黴菌的結構，這些內毒素具有刺激免疫細胞的功能，可以讓我們體內的免疫反應往第一型T輔助細胞的方向進行。）
所以提出「清潔理論」的學者認為，過敏免疫疾病之所以逐年增加，主要的原因在於我們目前的環境無法有效地在小寶寶身上誘發出較好的第一型T輔助細胞反應，所以導致較高的第二型T輔助細胞反應反應和過敏疾病。
也就是隨著文明的愈進步，在生活環境中接觸到病原體的機會愈來愈少；而且利用疫苗來對抗各種感染也愈來愈多和普遍，所以才導致我們的免疫系統訓練不足，無法產生較好的第一型的免疫反應，讓過敏疾病逐年增加。
《戒吃、戒抓，告別異位性皮膚炎》
