全國高中職以下學校已經開學，接下來大專院校也將在9月中旬起陸續開學。為了加強校園防疫，臺北市政府訂定「大學防疫工作的建議指引」，包括教職員工須完成疫苗接種，學生上課要固定座位、落實點名，教學上減少脫下口罩的課程。
臺北市蔡炳坤副市長表示，大學防疫指引比照目前中小學的規定，學校教職員若未完成疫苗接種14天，須持有3天內快篩或PCR陰性證明，每7天做1次。教學部分減少要脫下口罩的課程，像是音樂課要吹奏樂器，調整為回家練習；而游泳池則須配合防疫規定。學校社團或舉辦大型集會活動要遵照防疫規定，目前規定室內上限80人、室外100人；若真的有需要超過人數，要按規定提報計畫，經地方主管機關核准後才能實施。
由於大學教學型態多元，學生多是跑班選課、選修，上課沒有固定教室和座位，因此將要求學校第1堂課就要固定座位；並落實實名制，老師在每堂課開始前要點名，每堂課開始前，教師都要點名，落實實名制，未來如果有師生確診才便於疫調。
假若學校內有疑似個案或確診者，就要依照規定通報，北市府也會進到學校疫調匡列，必須要做到居家隔離，若學校師生有一位確診，老師教的班級、及學生上課的班級，要14天停課，若一個校區有兩位，也要停課14天。
學校餐飲部分，校內的美食街和餐廳要落實實聯制，用餐環境要通風，供應個人套餐，使用隔板入座，不併桌、不交談，用餐後落實清潔消毒。
大學宿舍部分採實聯制、量測體溫、公共空間要落實清消工作；隔離宿舍採獨棟或單獨樓層、動線分流、1人1間、獨立衛浴，比照防疫旅館規定並由防疫人員審核。
蔡炳坤副市長指出，雖然大學的主管機關為教育部，但防疫工作是與地方政府息息相關，任何大學相關防疫需求，北市府都全力支援協助。本項建議指引將等待教育部的版本出爐，進行對照及討論後，才會對外公告。
