中央流行疫情指揮中心5日宣布，由於中國大陸肺炎疫情不斷升溫，因此從2月6日起，將中國全區及港澳列為疫情二級流行地區，國人有中港澳旅遊史者，回國必須居家檢疫14天，若有失聯或違反規定者，將會法辦。
中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中表示，中國新型冠狀病毒肺炎(武漢肺炎)疫情累積確診病例數持續快速上升，截至4日為止，總病例數超過兩萬例，範圍涵蓋中國大陸全區，各省市陸續出現大規模社區群聚感染，且各大城市開始管制陸運及限制居民移動等措施，可見中國大陸疫情社區傳播範圍可能擴大，在考量中國疫情嚴峻且與我國往來密切，因此宣布，將中國全區及港澳的列為二級疫情流行區，從2月6日起，國人只要有中港澳旅遊史，回國後都必須列入居家檢疫14天，但有申請獲准到港澳返國者，則是必須主健康管理14天，而居住地在中國各省市的大陸人士暫緩入境，港澳人士雖可入境，但是必須居家檢疫14天。
但是，最近傳出有些國人填寫不實的個人資料搞失聯，還有隱匿旅遊史，躲避居家隔離，還有居家隔離者到處跑，內政部長徐國勇表示，對於需要居家檢疫及隔離者，將透過民政系統結合村里幹事，進行訪查，通通要掌握行蹤，失聯者，警方將以尋找重大刑案規格協尋，徐國勇也呼籲居家隔離、檢疫者要自律，因為若違反相關規定，將依傳染病防治法、社會秩序維護法及刑法的偽造文書等法辦。
指揮中心也提醒，自2月7日起，14天內曾經入境或居住於中國、香港、澳門的外籍人士，暫緩入境，未來指揮中心也會嚴密監控疫情變化，視疫情演變隨時調整流行地區及旅遊建議範圍。
