疾管署10月25日接獲通報，台北市某流感疫苗接種站發現變質流感疫苗，目測外觀明顯變色，為確保民眾接種安全，已通知獲配該批號疫苗之7個地方政府衛生局暫停撥發該批號疫苗。
公費流感疫苗已於10月15日開打，現卻傳出有疫苗疑似變質的消息，台北市某醫院於10月24日至社區設立流感疫苗接種站時，發現1劑目測外觀明顯變色之流感疫苗，並通報疾管署。據報導，正常疫苗應是透明無色，這支問題疫苗卻呈現茶水般的咖啡色，目前初判變色疫苗應是單一事件。
疾管署表示，和問題疫苗同一批號之疫苗共約30萬劑，已配送至7個地方政府衛生局共19萬餘劑，尚有10萬餘劑尚未配送。疾管署副署長莊人祥表示，這7個縣市分別是台北市、新北市、桃園市、新竹市、新竹縣、苗栗縣、台中市，疾管署也已派員勘查未配送之同批號疫苗，並未發現其他疫苗有類似情形。
為確保民眾接種安全，疾管署已通知獲配該批號疫苗之7個地方政府衛生局暫停撥發該批號疫苗，且請收到同批號疫苗的醫療院所，暫時停用該批號疫苗，並檢視疫苗外觀，如有發現變色等類似情形，應主動通報疾管署，而目前並未再接獲類似通報。
疾管署已於10月26日邀集專家、衛生福利部食品藥物管理署、台北市政府衛生局及疫苗廠商召開會議探討疫苗品質及接種安全。另針對本次事件食藥署已要求廠商依藥品不良品通報機制，儘速調查釐清。
此批疫苗的所屬公司賽諾菲也發出新聞稿，表示已將該支疫苗送回法國總公司進行檢驗，並要求總公司盡速提供檢驗及調查報告，以盡快釐清單支疫苗變色的原因。
